Informasi Detil Paper


Judul: Hubungan Filogentik Beberapa Spesies Anggota Genus Rhodobacter Berdasarkan Sekuens Gen rho dan gmk
Penulis: Edwin Thomas Apituley  || email: info@mx.unpatti.ac.id
Jurnal: Prosiding Seminar Nasional Biologi 2017 Vol. 1 no. 1 - hal. 169-174 Tahun 2017  [ KIP ]
Keywords:  Genus Rhodobacter, gen 16S rRNA, gen rho, gen gmk, analisis filogenetik
Abstract: Genus Rhodobacter merupakan anggota filum Proteobacteria, kelas Alpha proteobacteria, ordo Rhodobacterales yang memiliki angota spesies yang mampu untuk hidup pada berbagai jenis habitat yang berbeda; padadaratan, air tawar hingga pada air payau dan air asin. Hubungan filogenetik antar spesies dalam genus Rhodobacter ditentukan dengan menggunakan informasi sekuen 16S rRNA maupun homologi DNA genom.Beberapa molekul yang penting bagi proses kehidupan didalam sel bakteri seperti gen rho dan gmk dapat digunakan sebagai alternatif dan pelengkap analisis filogenetik yang dilakukan dengan menggunakan sekuen gen 16S rRNA. Konstruksi pohon filogenetik dilakukan berdasarkan sekuen gen 16S rRNA, rho dan gmk dengan metode Neighbor Joining model Jukes- Cantor untuk mengukur jarak genetik, analisis bootstrap terhadap percabangan pohon filogenetik dilakukam dengan menggunakan 1000 pengulangan.Hasil penelitian menunjukkan adanya perbedaan topologi dari masing-masing pohon filogenetik yang dikonstruksi dari sekuen gen 16S rRNA, rho dan gmk, dimana konstruksi berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan pemisahan yang lebih baik anggota genus Rhodobacter berdasarkan habitatnya maupun anggota genus Rhodobacter terhadap anggota genus non-Rhodobacter.
File PDF: Download fulltext PDF PDF

<<< Previous Record Next Record >>>